Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms