Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PparaP23204 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PparaP23204 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PparaP23204 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PparaP23204 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PparaP23204 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PparaP23204 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PparaP23204 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PparaP23204 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PparaP23204 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PparaP23204 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PparaP23204 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms