Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BdnfP21237 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms