Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim1P20664 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim1P20664 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim1P20664 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms