Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ms4a2P20490 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a2P20490 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms