Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcaP20444 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms