Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfaP20033 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms