Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NelfeP19426 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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