Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd48P18181 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd48P18181 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms