Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PcnaP17918 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PcnaP17918 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PcnaP17918 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcnaP17918 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms