Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgfr1P16092 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgfr1P16092 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms