Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rag1P15919 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rag1P15919 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rag1P15919 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rag1P15919 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rag1P15919 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rag1P15919 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rag1P15919 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rag1P15919 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rag1P15919 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms