Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FosbP13346 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FosbP13346 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FosbP13346 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FosbP13346 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FosbP13346 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FosbP13346 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FosbP13346 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FosbP13346 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FosbP13346 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FosbP13346 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FosbP13346 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FosbP13346 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FosbP13346 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FosbP13346 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms