Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spp1P10923 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spp1P10923 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spp1P10923 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms