Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd4P10628 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd4P10628 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms