Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa6P09092 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxa6P09092 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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