Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd3P09027 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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