Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms