Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NeflP08551 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NeflP08551 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeflP08551 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeflP08551 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NeflP08551 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NeflP08551 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NeflP08551 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NeflP08551 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NeflP08551 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NeflP08551 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NeflP08551 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NeflP08551 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NeflP08551 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NeflP08551 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NeflP08551 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NeflP08551 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NeflP08551 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NeflP08551 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms