Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Egr1P08046 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Egr1P08046 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms