Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SparcP07214 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SparcP07214 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SparcP07214 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SparcP07214 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SparcP07214 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms