Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf1P07141 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf1P07141 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms