Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CrygdP04342 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms