Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P04213 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P04213 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04213 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04213 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04213 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04213 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04213 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms