Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tgfb1P04202 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgfb1P04202 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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