Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lamc1P02468 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamc1P02468 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamc1P02468 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms