Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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H2-Ab1P01921 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-Ab1P01921 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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H2-Ab1P01921 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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H2-Ab1P01921 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-Ab1P01921 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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