Protein–RNA interactions for Protein: P01677

Ig kappa chain V-VI region TEPC 601/TEPC 191, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01677 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01677 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01677 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01677 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01677 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01677 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01677 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01677 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
P01677 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01677 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01677 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms