Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01671 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01671 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01671 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01671 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01671 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01671 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms