Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01667 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01667 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01667 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01667 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01667 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01667 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01667 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01667 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01667 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01667 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01667 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01667 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms