Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01665 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01665 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01665 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01665 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01665 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01665 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01665 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01665 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01665 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01665 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01665 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01665 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01665 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01665 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01665 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms