Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01656 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01656 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01656 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01656 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01656 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01656 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01656 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01656 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01656 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01656 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01656 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01656 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01656 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01656 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01656 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01656 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01656 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01656 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01656 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms