Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01653 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01653 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01653 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01653 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01653 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01653 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01653 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01653 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01653 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01653 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01653 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01653 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01653 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01653 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01653 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01653 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01653 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01653 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01653 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01653 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms