Protein–RNA interactions for Protein: P01637

Ig kappa chain V-V region T1, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01637 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01637 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01637 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01637 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01637 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01637 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01637 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01637 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01637 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01637 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01637 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01637 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01637 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01637 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms