Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnpda1O88958 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms