Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MscO88940 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MscO88940 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MscO88940 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MscO88940 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MscO88940 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MscO88940 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms