Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hcn2O88703 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hcn2O88703 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms