Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BlmO88700 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BlmO88700 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BlmO88700 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BlmO88700 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BlmO88700 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BlmO88700 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BlmO88700 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BlmO88700 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BlmO88700 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BlmO88700 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BlmO88700 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BlmO88700 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BlmO88700 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BlmO88700 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BlmO88700 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BlmO88700 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BlmO88700 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BlmO88700 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BlmO88700 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BlmO88700 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BlmO88700 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BlmO88700 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BlmO88700 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BlmO88700 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BlmO88700 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BlmO88700 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BlmO88700 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BlmO88700 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BlmO88700 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BlmO88700 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BlmO88700 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BlmO88700 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BlmO88700 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BlmO88700 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BlmO88700 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms