Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brd7O88665 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd7O88665 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms