Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops3O88543 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops3O88543 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops3O88543 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops3O88543 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops3O88543 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops3O88543 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops3O88543 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops3O88543 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms