Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl22O88430 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ccl22O88430 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms