Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10139O88245 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm10139O88245 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm10139O88245 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm10139O88245 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm10139O88245 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm10139O88245 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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