Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xirp1O70373 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms