Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psmb5O55234 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb5O55234 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms