Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Supt5hO55201 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms