Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sept7O55131 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Sept7O55131 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Sept7O55131 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sept7O55131 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Sept7O55131 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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Sept7O55131 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Sept7O55131 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Sept7O55131 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Sept7O55131 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sept7O55131 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms