Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Copb2O55029 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copb2O55029 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms