Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnk2O54967 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnk2O54967 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms