Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LatO54957 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LatO54957 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LatO54957 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LatO54957 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LatO54957 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LatO54957 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms