Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema6bO54951 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema6bO54951 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms